O empresário foi encontrado morto em casa por familiares após ter saído para correr. A causa da morte ainda não foi confirmada. Suspeita-se de enfarte ou aneurisma. “O empresário deixa quatro filhos e esposa. A família pede que seu luto seja respeitado neste momento difícil”, diz nota divulgada pela assessoria de imprensa dos Diniz.
João Paulo também era conhecido por projetos de incentivo ao esporte. Em 2001, sobreviveu a um acidente aéreo. Em uma viagem no litoral de São Paulo, o helicóptero no qual estava caiu, matando o piloto e a então namorada do empresário, a modelo Fernanda Vogel.